СИДНЕЙ (Рейтер) - По мере распространения по всему миру коронавирус SARS-CoV-2 за год унес жизни более 1,5 миллиона человек. При этом вирус мутировал, и сейчас исследователи выделяют семь его основных групп, или штаммов.
Классификация и понимание этих изменений вируса имеет решающее значение для разработки стратегий борьбы с COVID-19.
"Причина изучения геномики (вируса) состоит в том, чтобы попытаться выяснить, откуда он взялся… с точки зрения попыток составить карту того, что мы ожидаем от пандемии, эта информация имеет решающее значение", - сказала Никола Спурриер, главный санитарный врач Южной Австралии.
Рейтер проанализировал более 185.000 образцов генома, имеющихся в распоряжении Глобальной инициативы по совместному использованию всех данных о гриппе (GISAID) - крупнейшей базы данных о последовательностях генома нового коронавируса в мире, чтобы показать, как доминирующие основные штаммы изменились с течением времени.
Первоначальный новый коронавирус, обнаруженный в китайском городе Ухань в декабре 2019 года - это штамм L. Затем в начале 2020 года вирус мутировал в штамм S. За ним последовали штаммы V и G. Штамм G еще больше мутировал в штаммы GR, GH и GV. Несколько других редких мутаций были сгруппированы вместе как штамм O.
(График Рейтер: https://tmsnrt.rs/3n9197O)
ОТСЛЕЖИВАНИЕ МУТАЦИЙ
Ранее, в начале пандемии, вирус относительно быстро распространялся по миру, регулярно вызывая новые вспышки. В то время среди образцов, представленных в GISAID, было более разнообразное сочетание штаммов.
По мере закрытия границ новых штаммов стало появляться все меньше, а в странах, где присутствовали более устойчивые штаммы типа G, они стали доминировать.
В Азии первоначальный штамм L сохранялся дольше, поскольку несколько стран, включая Китай, быстро закрыли границы и запретили передвижение. Северная Америка и Европа, напротив, не так сильно ограничивали передвижение, по крайней мере, на начальном этапе, что позволило штаммам G распространяться - и мутировать - более быстрыми темпами.
Штаммы G сейчас доминируют во всем мире. Одна специфическая мутация, D614G, получила наибольшее распространение.
ПОЧЕМУ МУТАЦИИ ВАЖНЫ
Вирус SARS-CoV-2 до сих пор мутировал медленно, что позволило ученым и регуляторам отслеживать его изменения.
Тем не менее, ученые разделились во мнениях о последствиях некоторых мутаций. Некоторые эксперты говорят, что вариант D614G сделал вирус более заразным, однако другие опровергают это.
В любом случае, мутации пока не привели к появлению штаммов, которые с высокой степенью вероятностью будут устойчивы к разрабатываемым вакцинам.
Однако эксперты, которые годами наблюдали, как грипп и ВИЧ мутируют в устойчивые к вакцинам штаммы, предупреждают, что предвидеть, что произойдет с SARS-CoV-2 в будущем, невозможно, поэтому лучший способ предотвратить изменения, которые сделают вирус невосприимчивым к вакцине - это ограничить его распространение и уменьшить возможности для мутаций.
(Джейн Уорделл, Джитеш Чоудхури и Саймон Скарр. Перевел Алексей Кузьмин. Редактор Анна Козлова)